V současné době existují dva možné způsoby přihlášení do Elektronické přepážky:
Prostřednictvím SMS kódu
Tento způsob je podobný způsobu, který používají komerční banky. K jeho používání stačí mít u sebe svůj mobilní telefon.
- Na stránce pro přihlášení do Elektronické přepážky vložíte své přihlašovací jméno a heslo.
 - Kliknete na tlačítko „zaslat SMS kód". Kód je bezprostředně zaslán na váš mobilní telefon, uvedený ve smlouvě.
 - Opíšete obdržený kód do příslušného políčka a odesláním údajů dokončíte přihlášení.
 
Výhody tohoto způsobu jsou jednoznačné:
- nemusíte každoročně obnovovat certifikát
 - lze se přihlásit z jakéhokoliv PC, stačí mít u sebe svůj mobil
 - míra zabezpečení je shodná s přihlašováním pomocí certifikátu
 - v případě ztráty mobilu lze přihlašování přes SMS kódy zablokovat
 - lze snadno změnit číslo pro zasílání SMS kódů
 - vše je pro vás zdarma
 - internetový prohlížeč nemusí mít nainstalovány doplňky, lze použít jakýkoliv prohlížeč
 
Prostřednictvím certifikátu (elektronického podpisu)
Tento způsob byl využíván od začátku existence naší Elektronické přepážky a zůstal samozřejmě zachován. K jeho používání musíte mít na svém počítači nainstalován platný kvalifikovaný nebo komerční certifikát. Můžete využít kterýkoliv z uznávaných certifikátů, například certifikát, který používáte pro komunikaci se svou bankou. Přihlášení do Elektronické přepážky je jednoduché:
- Na stránce pro přihlášení do Elektronické přepážky vložíte své přihlašovací jméno a heslo.
 - Po odeslání údajů bude vyhledán certifikát nainstalovaný na počítači. Pokud máte nainstalováno více certifikátů, budete vyzván ke zvolení správného certifikátu.
 - Pokud certifikát souhlasí s certifikátem zavedeným do prostředí Elektronické přepážky a je platný, budete přihlášen.